Ještě hůř než Button dopadl další adept na titul Sebastian Vettel. Mladý Němec vypadl na vodě už v úvodu kvalifikace a nedělní závod začne až jako šestnáctý.
Kvalifikace začalo naplno se zpožděním, protože hned v prvním kole dostal na vodě smyk Ital Fisichella, a jeho Ferrari zůstalo stát se zhasnutým motorem přímo na dráze.
Když byl okruh znovu otevřen, stále zesilující déšť dovolil pilotům jízdy za slušných podmínek jen pár minut. Němec Vettel zaváhal a jeho závěrečné pokusy na asfaltu, který křižovaly potoky vody, neměly šanci na úspěch.
Na začátku druhé části boje o místa na roštu déšť neustále sílil, a když havaroval další Ital Liuzzi, vedení závodu se rozhodlo kvalifikaci zastavit. Na pokračování se čekalo více než hodinu.
Do finálové části nepostoupil lídr šampionátu Jenson Button, jemuž nevyšla volba pneumatik. Na osychající dráze zůstal na gumách do extrémních podmínek, zatímco jeho soupeři létali kolem něj na přechodných pneumatikách. Výsledkem byl pro Buttona nejhorší čas ze všech čtrnácti jezdců na dráze.
V závěru kvalifikace se ukázalo, že Brit neměl k dispozici špatný monopost. Jeho týmový kolega z Brawnu Barrichello byl nejrychlejší ze všech a začne domácí Velkou cenu z první příčky.
Buttonovi stačí k zisku titulu jakékoliv umístění na stupních vítězů a nebude se muset ohlížet na výsledek svých soupeřů. Také v neděli má v Sao Paulu pršet, takže možné bude úplně všechno. Závod startuje v 18:00 SELČ.
První část kvalifikace (20 minut, jezdci jedou s minimem paliva, 5 nejpomalejších končí)
Hned po pár minutách zavlály červené vlajky a kvalifikace byla zastavena. Těžké časy Gianacarla Fisichelly ve Ferrari pokračují. Ital dostal smyk v zatáčkách Senna S a uvázl na dráze. Nepodařilo se mu znovu auto rozpohybovat.
Ferrari částečně blokovalo dráhu a trvalo několik minut, než bylo odklizeno. V čase 15:53 kvalifikace na mokré dráze pokračovala. Fisichella se vrátil na trať těsně před koncem jízd a zaútočit na postupové pozice už nedokázal.
A kdo nezajel ideální letmé kolo během následujících deseti minut, měl smůlu. Začalo totiž znovu pršet a vody na zpomalující dráze přibývalo. Smůlu tak měli kvůli špatnému načasování letmých kol oba jezdci McLarenu Hamilton a Kovalainen, stejně jako Heidfeld z týmu BMW.
Hamilton se v zoufalé snaze postoupit dostal na trávu, a byl rád, že se jeho vystoupení v kvalifikaci obešlo bez rány do bariéry.
Ale pro průběh letošního šampionátu byl zásadní jiný fakt. Postoupit nedokázal ani Sebastian Vettel. Ať se snažil sebevíc, do poslední chvíle létal po dráze, proudy vody na asfaltu mu zabránily uniknout ze 16. příčky. Bojovat o titul ze 16. příčky na startu nebude vůbec snadné.
Vettelovou nadějí je snad pouze fakt, že v Brazílie se může stát cokoliv, předjíždění tam patří do závodního reportoáru, a tak mu nezbývá nic jiného než jet jako o život.
Nejrychlejší čas 1:22,828 zajel Nico Rosberg z týmu BMW. Druhý nejrychlejší byl Kimi Räikkönen z Ferrari.
Druhá část kvalifikace (15 minut, jezdci jedou s minimem paliva, 5 nejpomalejších končí)
Začínalo se později, než bylo v plánu, protože prudší déšť na konci úvodní sekce kvalifikace přinesl na povrch dráhy více vody, než považovalo vedení závodu za bezpečné.
Druhá část kvalifikace začala v době, kdy už měla celá kvalifikace končit. A vody na dráze bylo tolik, že nebyl jezdec, který by dokázal celý okruh projet čistě. V čase 12:24 zavlály opět červené vlajky a kvalifikace byla přerušena.
Ital Liuzzi nezvládl na vodě řízení a na konci cílové rovinky opřel svůj monopost Force India o boxovou zídku. Od té se odrazil, přeletěl dráhu i únikovou zónu a záď svého stroje rozdrtil o pneumatikovou bariéru. Poté vystoupení z auta zamával divákům na znamení, že je v pořádku.
Znovu bylo odstartováno až po více než hodině! Všichni jezdci se v obavách z dalšího deště, který na chvíli povolil, vydali okamžitě na trať.
Rychlé byly opět williamsy, dařilo se i Räikkönenovi, ale nejlepší čas ze všech měl minutu před koncem Mark Webber, který po vypadnutí týmového kolegy Vettela držel nahoře prapor Red Bullu. V posledním letmém kole ho však ještě stihli překonat Rosberg, Nakadžima, Trulli i Sutil.
Nedařilo se hlavnímu favoritovi na titul Jensonu Buttonovi, který bude startovat jako čtrnáctý. Na mokru mu to vůbec nešlo. Jeho týmový kolega Barrichello postoupil těsně z desátého místa.
Skončili rovněž nováček Kobajaši s Toyotou, mladík Alguersuari s vozem Toro Rosso, Grosjean z Renaultu a samozřejmě Liuzzi, který po havárii nepokračoval.
Třetí část kvalifikace (10 minut, jezdci jedou s palivem pro závod)
O pole pozition si to podle očekávání rozdali Webber s Red Bullem, Trulli s Toyotou a Barrichella z Brawnu. K nim se ještě přidal Sutil z Force India, ale nejrychlejší byl domácí favorit Barrichello.
Za jásotu poloprázdných tribun absolvoval okruh nejrychleji ze všech a v neděli se pokusí připravit Jensona Buttona o další mečbol v boji o zisk titulu mistra světa 2009.
Výsledky:
| POŘADÍ | JMÉNO | NÁRODNOST | TÝM | ČAS |
| 1. | Rubens Barrichello | Brazílie | Brawn GP | 1:19,576 |
| 2. | Mark Webber | Austrálie | Red Bull | 1:19,668 |
| 3. | Adrian Sutil | Německo | Force India | 1:19,912 |
| 4. | Jarno Trulli | Itálie | Toyota | 1:20,097 |
| 5. | Kimi Räikkönen | Finsko | Ferrari | 1:20,168 |
| 6. | Sébastien Buemi | Švýcarsko | Toro Rosso | 1:20,250 |
| 7. | Nico Rosberg | Německo | Williams | 1:20,326 |
| 8. | Robert Kubica | Polsko | BMW Sauber | 1:20,631 |
| 9. | Kazuki Nakadžima | Japonsko | Williams | 1:20,674 |
| 10. | Fernando Alonso | Španělsko | Renault | 1:21,422 |
| 11. | Kamuj Kobajaši | Japonsko | Toyota | 1:21,960 |
| 12. | Jaime Alguersuari | Španělsko | Toro Rosso | 1:22,231 |
| 13. | Romain Grosjean | Francie | Renault | 1:22,477 |
| 14. | Jenson Button | Velká Británie | Brawn GP | 1:22,504 |
| 15. | Vitantonio Liuzzi | Itálie | Force India | bez času |
| 16. | Sebastian Vettel | Německo | Red Bull | 1:25,009 |
| 17. | Heikki Kovalainen | Finsko | McLaren | 1:25,052 |
| 18. | Lewis Hamilton | Velká Británie | McLaren | 1:25,192 |
| 19. | Nick Heidfeld | Německo | BMW Sauber | 1:25,515 |
| 20. | Giancarlo Fisichella | Itálie | Ferrari | 1:40,703 |
