Vyšetřující soudce Antonio Serrano už případ, který před dvěma lety připravil například Jana Ullricha nebo Ivana Bassa o start na Tour de France, před rokem uzavřel. Nevznesl žádná obvinění s vysvětlením, že ještě neplatil nový antidopingový zákon.
Letos v únoru však španělský soud nařídil znovuotevření celého případu s tím, že zatčení mohli zprostředkováním dopingu ohrozit zdraví cyklistů, čímž by se dopustili trestného činu bez ohledu na antidopingový zákon.
Podle výsledků následného šetření však sáčky s krví, které policie v roce 2006 objevila při raziích v laboratořích v Madridu a Zaragoze, neobsahovaly dostatečné množství zakázaného EPO k tomu, aby bylo ohroženo zdraví cyklistů.
Vedle asi 100 sáčků se zmraženou krví byly v laboratořích nalezeny anabolické steroidy a prostředky pro krevní transfuzi. Ve spojitosti s Operací Puerto bylo zatčeno pět lidí, žádný z nich však nebyl nikdy obviněn.