Dvojnásobný mistr Evropy a mistr světa z roku 2014 měl v Tokiu stejně jako všichni favorité v 1. kole volný los. Ve druhém porazil Venezuelana Anthoniho Peňu, proti kterému po třech a půl minutách získal ippon.
Následně svedl vyrovnanou bitvu s Naidanem, kterého před dvěma roky na stejném turnaji porazil. Tentokrát ale oba soupeři získali jen po jednom trestu a rozhodnout muselo prodloužení. V něm hned v úvodu udělal Krpálek chybu a zkušený Mongol získal rozhodující juko. Naidan následně prohrál čtvrtfinále i v opravách a do bojů o medaile se nedostal.
V Japonsku se nedařilo ani dalším dvěma českým reprezentantům. Radek Helc rovněž v kategorii do 100 kg prohrál s devatenáctiletým japonským reprezentantem Aaronem Wolfem. Jaromír Ježek v kategorii do 73 kg také nestačil v úvodním kole na domácího judistu Sojčiho Hašimota.